第11集
久居海外的海盗头子王直，和日本人之间矛盾升级。王直派出义子王 私下面见胡宗宪，想和大明朝廷谈判。然而中秋之夜，胡宗宪却没能等来王直，竟等来了戚继光。原来，戚继光早就暗中盯住了王直的行动路线，直接将其捉拿，押进了胡宗宪的大牢。戚继光苦口婆心劝胡宗宪，对出卖国家利益的叛徒不能姑息养奸，更不能谈判。两个人争执不下，于是各自向朝廷上了奏疏，皇帝主张杀王直。王直死后，倭寇反扑，岑港沦陷。这一仗一打就是一年多，俞大猷始终不能获胜。戚继光向俞大猷立下军令状，由自己全盘接手战略指挥。
第12集
戚继光接手指挥后，迟迟没有组织起像样的进攻。就在期限的最后一天，戚继光突然找到俞大猷，和盘托出整个作战计划。原来，早在胡宗宪进京请旨之时，他就做好了全盘布置，为岑港决战做了三项必要的准备：一，暗中联系徐渭，制造兵器，打造了克制倭寇蝴蝶阵的利器——狼筅;二，欲擒故纵，抓住了倭寇潜藏在明军岑港大营中的奸细;三，巧用疲敌之策，连续发起毫无威胁的进攻，令倭寇错误地判断了明军的战斗力。明军势如破竹，一鼓作气将岑港主寨攻克。长谷堪助率领日本武士亲信由海路暂退。
第13集
长谷堪助其实并没有真正撤退，他纠集了昔日王直的五峰船队，由海上向岑港发起了反扑。戚继光主动迎敌，以大明水师正面迎战倭寇水师。海战中，突如其来的大雾令双方都陷入了进退两难、生死一线的局面。戚继光取出了他这个大发明家的另一件神器——计算时间的串珠。他计算着风向、时间、船速。在双方都不敢开炮暴露位置的关头，命令主炮齐射，在完全看不见敌船的情况下，竟然有半数炮弹命中倭寇船只。长谷堪助被打懵了，立刻撤退。俞大猷主张乘胜追击，而一向胆大的戚继光此刻却极为谨慎，鸣金收兵。
第14集
戚继光因为这次撤退，遭到了朝中言官御史们的弹劾。严嵩父子借机对戚继光发难，戚继光被解职，押送进京由三法司会审。徐渭出奇策，要王昱竹去寻找一头传说中的白鹿，怎料，竟然真的在岑港后山寻到了传说中的白鹿。原来，这是胡宗宪和徐渭商量的对策，徐渭立刻写下了一篇违心的千古马屁文《进白鹿表》进京面圣。严嵩之子严世蕃主持三法司会审，避而不谈事实，只问戚继光有没有通倭，意图将戚继光屈打至死。命悬一线之际，嘉靖贴身太监冯保带着口谕来，救下了戚继光。
第15集
冯保的到来是嘉靖的安排，收到了白鹿的嘉靖心情愉悦，相信这是苍天的某种暗示。另一方面，嘉靖想采用制衡之术，不能让严家太过嚣张。皇帝面见戚继光，君臣二人叙谈。戚继光提出了建立一支募兵制军队的想法，嘉靖皇帝暗旨内阁，给戚继光行便利。戚继光回到龙山所，与王昱竹喜结连理。新婚之夜，这对历经磨难才得以结合的夫妻却心事重重，戚继光无处选练新军。戚继光孤身一人穿梭在台州大街，偶遇一直以为死了的沈黛云和掬月。沈黛云之夫唐献之献策，称义乌人骁勇团结。
第16集
招兵令一下，义乌县几万人全都争相入伍。义乌人的荣誉感很强，四邻八乡都把落选当成羞耻，戚继光必须出台一条既能服众，又对军队建设有益的选拔标准。一天一夜后，戚继光拿出了一条令人瞠目结舌，却必然永载史册的征兵条例。所谓的“四要四不要”，其古怪苛刻程度，比几百年后的选美更严格。按照戚继光的标准，竟然也召到了满员的三千人。胡宗宪准备清缴徐海，戚继光主张收降。胡宗宪斟酌再三，采纳了戚继光的策略。
第17集
倭寇得知新河城新兵初成，派小股部队奇袭新河城。戚继光引100多人的小部队出城，主动寻战。哪知情报有误，戚继光发现倭寇数量足有五六倍之多。他利用游击战术，歼灭敌人有生力量。意外接踵而至，一支由年轻大明将领欧阳深率领的僧兵队伍加入了战斗。原来，欧阳深是福建的指挥佥事，曾是少林俗家弟子，俞大猷的同门师弟。他率领僧兵追击一股袭扰福建的倭寇。这一追，竟然追到了浙江境内。戚继光和欧阳深结下了深厚的兄弟情义。
第18集
朝廷送给戚家军的粮草，竟无缘无故消失在江西境内。嘉靖震怒，严嵩费尽心机，东挪西凑补上了缺，但新军的粮草、武器难免逾期。戚继光一筹莫展的时候，沈黛云和唐献之用自家的钱财，购买了大批粮草，缓解了戚继光的断粮之危。岑港之战中，狼筅虽然发挥出决胜优势，但狼筅兵一旦遭到包围，就会受伤失去战斗力。一个偶然的机会，戚继光手下的两拨士兵训练太过认真，发生了冲突。他命令士兵们按照混战的方式继续打斗，自己在一旁观察种种兵器的混编配合。
第19集
一夜时间，戚继光改良了原有的阵型，名垂千古的“鸳鸯阵”出现了。此阵利用对称原理，要求十余人同进同退，各种武器相互配合，攻守兼备。唐刀的复原工作也有了成果，针对倭刀的弱点，戚继光发明出了克制倭刀的戚家刀。倭寇大军登陆宁海，瞬间击溃当地守军，屠杀劫掠，向内陆推进。戚继光留下新河空城，率领全部三千新军长途奔袭宁海迎战。初步侦察敌情后，戚继光将本就在数量上处于劣势的部队拆分成了三队，一半士兵由胡守仁带领，留在渔村中，他甚至把自己主帅的披挂留给了胡守仁，只是为了迷惑敌人。
第20集
长谷堪助决定在白天抢先发动进攻，这一来正中了戚继光的计策。剩下的一半军队，被戚继光再一分为二，杨文率领一支部队取道最远的大路，突袭倭寇身后。而戚继光仅率四分之一的士兵，正面接敌。杨文赶到倭寇后方，发现倭寇没有留下主力，但他依旧主动进攻，留守的向次郎被打得晕头转向，率部快速靠拢长谷堪助主力。因为杨文不按计划作战，戚继光一下子由优势转为劣势，他临时改变策略，将军队再次拆散，布置了十面包围的策略。长谷堪助向北撤退，哪想到必经之路上戚继光早就布置了人马埋伏。
